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Development of MALDI-TOF mass spectrometry for the identification of lice isolated from farm animals.

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Development of MALDI-TOF mass spectrometry for the identification of lice isolated from farm animals.

Auteurs : Basma Ouarti [France] ; Maureen Laroche [France] ; Souad Righi [Algérie] ; Mohamed Nadir Meguini [Algérie] ; Ahmed Benakhla [Algérie] ; Didier Raoult [France] ; Philippe Parola [France]

Source :

RBID : pubmed:32351208

Descripteurs français

English descriptors

Abstract

Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is now routinely used for the rapid identification of microorganisms isolated from clinical samples and has been recently successfully applied to the identification of arthropods. In the present study, this proteomics tool was used to identify lice collected from livestock and poultry in Algeria. The MALDI-TOF MS spectra of 408 adult specimens were measured for 14 species, including Bovicola bovis, B. ovis, B. caprae, Haematopinus eurysternus, Linognathus africanus, L. vituli, Solenopotes capillatus, Menacanthus stramineus, Menopon gallinae, Chelopistes meleagridis, Goniocotes gallinae, Goniodes gigas, Lipeurus caponis and laboratory reared Pediculus humanus corporis. Good quality spectra were obtained for 305 samples. Spectral analysis revealed intra-species reproducibility and inter-species specificity that were consistent with the morphological classification. A blind test of 248 specimens was performed against the in-lab database upgraded with new spectra and validated using molecular tools. With identification percentages ranging from 76% to 100% alongside high identification scores (mean = 2.115), this study proposes MALDI-TOF MS as an effective tool for discriminating lice species.

Title

Développement de la spectrométrie de masse MALDI-TOF MS pour l’identification de poux isolés d’animaux de ferme.

Abstract

La Spectrométrie de Masse à Temps de Vol par Désorption/Ionisation Laser Assistée après Matrice est maintenant utilisée pour l’identification rapide des microorganismes isolés à partir d’échantillons cliniques et a récemment été appliquée avec succès pour l’identification des arthropodes. Dans cette étude, cet outil protéomique a été utilisé pour identifier les poux prélevés sur le bétail et la volaille en Algérie. Les spectres MALDI-TOF MS de 408 spécimens adultes ont été mesurés pour 14 espèces, dont Bovicola bovis, B. ovis, B. caprae, Haematopinus eurysternus, Linognathus africanus, L. vituli, Solenopotes capillatus, Menacanthus stramineus, Menopon gallinae, Chelopistes meleagridis, Goniocotes gallinae, Goniodes gigas, Lipeurus caponis et Pediculus humanus corporis élevé en laboratoire. Des spectres de bonne qualité ont été obtenus pour 305 échantillons. L’analyse spectrale a révélé une reproductibilité intra-espèce et une spécificité inter-espèces qui concordaient avec la classification morphologique. Un test à l’aveugle de 248 échantillons a été effectué par rapport à la base de données de notre laboratoire mise à niveau avec de nouveaux spectres et validée à l’aide d’outils moléculaires. Avec des pourcentages d’identification allant de 76 à 100 % et des scores d’identification élevés (moyenne : 2,115), cette étude propose MALDI-TOF MS comme un outil efficace pour distinguer les espèces de poux.


DOI: 10.1051/parasite/2020026
PubMed: 32351208
PubMed Central: PMC7191974


Affiliations:


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<p>Développement de la spectrométrie de masse MALDI-TOF MS pour l’identification de poux isolés d’animaux de ferme.</p>
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<b>Abstract</b>
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<p>La Spectrométrie de Masse à Temps de Vol par Désorption/Ionisation Laser Assistée après Matrice est maintenant utilisée pour l’identification rapide des microorganismes isolés à partir d’échantillons cliniques et a récemment été appliquée avec succès pour l’identification des arthropodes. Dans cette étude, cet outil protéomique a été utilisé pour identifier les poux prélevés sur le bétail et la volaille en Algérie. Les spectres MALDI-TOF MS de 408 spécimens adultes ont été mesurés pour 14 espèces, dont Bovicola bovis, B. ovis, B. caprae, Haematopinus eurysternus, Linognathus africanus, L. vituli, Solenopotes capillatus, Menacanthus stramineus, Menopon gallinae, Chelopistes meleagridis, Goniocotes gallinae, Goniodes gigas, Lipeurus caponis et Pediculus humanus corporis élevé en laboratoire. Des spectres de bonne qualité ont été obtenus pour 305 échantillons. L’analyse spectrale a révélé une reproductibilité intra-espèce et une spécificité inter-espèces qui concordaient avec la classification morphologique. Un test à l’aveugle de 248 échantillons a été effectué par rapport à la base de données de notre laboratoire mise à niveau avec de nouveaux spectres et validée à l’aide d’outils moléculaires. Avec des pourcentages d’identification allant de 76 à 100 % et des scores d’identification élevés (moyenne : 2,115), cette étude propose MALDI-TOF MS comme un outil efficace pour distinguer les espèces de poux.</p>
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<VernacularTitle>Développement de la spectrométrie de masse MALDI-TOF MS pour l’identification de poux isolés d’animaux de ferme.</VernacularTitle>
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<AbstractText Label="Title" NlmCategory="UNASSIGNED">Développement de la spectrométrie de masse MALDI-TOF MS pour l’identification de poux isolés d’animaux de ferme.</AbstractText>
<AbstractText Label="Abstract" NlmCategory="UNASSIGNED">La Spectrométrie de Masse à Temps de Vol par Désorption/Ionisation Laser Assistée après Matrice est maintenant utilisée pour l’identification rapide des microorganismes isolés à partir d’échantillons cliniques et a récemment été appliquée avec succès pour l’identification des arthropodes. Dans cette étude, cet outil protéomique a été utilisé pour identifier les poux prélevés sur le bétail et la volaille en Algérie. Les spectres MALDI-TOF MS de 408 spécimens adultes ont été mesurés pour 14 espèces, dont Bovicola bovis, B. ovis, B. caprae, Haematopinus eurysternus, Linognathus africanus, L. vituli, Solenopotes capillatus, Menacanthus stramineus, Menopon gallinae, Chelopistes meleagridis, Goniocotes gallinae, Goniodes gigas, Lipeurus caponis et Pediculus humanus corporis élevé en laboratoire. Des spectres de bonne qualité ont été obtenus pour 305 échantillons. L’analyse spectrale a révélé une reproductibilité intra-espèce et une spécificité inter-espèces qui concordaient avec la classification morphologique. Un test à l’aveugle de 248 échantillons a été effectué par rapport à la base de données de notre laboratoire mise à niveau avec de nouveaux spectres et validée à l’aide d’outils moléculaires. Avec des pourcentages d’identification allant de 76 à 100 % et des scores d’identification élevés (moyenne : 2,115), cette étude propose MALDI-TOF MS comme un outil efficace pour distinguer les espèces de poux.</AbstractText>
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<ReferenceList>
<Reference>
<Citation>Insect Biochem Mol Biol. 2018 Feb;93:47-56</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">29248738</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Clin Infect Dis. 2017 Aug 15;65(suppl_1):S30-S38</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">28859353</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Parasitology. 2019 Apr;146(4):462-471</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">30269696</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Parasit Vectors. 2018 Nov 3;11(1):574</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">30390691</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Parasit Vectors. 2018 May 2;11(1):281</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">29720246</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Parasitol Res. 2014 Feb;113(2):723-6</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">24292542</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Proteomics. 2016 Dec;16(24):3148-3160</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">27862981</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>PLoS Negl Trop Dis. 2017 Jul 24;11(7):e0005762</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">28742123</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Med Trop (Mars). 2005;65(1):13-23</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">15903070</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Med Vet Entomol. 2017 Dec;31(4):438-448</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">28722283</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Future Microbiol. 2016;11(4):549-66</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">27070074</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>BMC Evol Biol. 2010 Sep 22;10:292</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">20860811</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Malar J. 2017 Jan 3;16(1):5</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">28049524</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Vet Parasitol. 2010 Dec 15;174(3-4):355-8</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">20943320</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Proc Biol Sci. 2004 Sep 7;271(1550):1771-6</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">15315891</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Rev Bras Parasitol Vet. 2011 Jan-Mar;20(1):17-21</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">21439226</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>PLoS One. 2017 Sep 26;12(9):e0185430</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">28950023</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>J Clin Microbiol. 2015 Feb;53(2):410-8</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">25411169</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Mol Phylogenet Evol. 2003 Feb;26(2):231-42</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">12565034</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Comp Immunol Microbiol Infect Dis. 2018 Apr;57:39-49</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">30017077</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Rev Sci Tech. 1994 Dec;13(4):1039-51</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">7711304</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Clin Infect Dis. 2001 Mar 15;32(6):897-928</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">11247714</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>J Clin Microbiol. 2017 Feb;55(2):369-379</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">27807151</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Sci Rep. 2015 Nov 30;5:17389</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">26617060</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Parasit Vectors. 2014 Dec 02;7:544</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">25442218</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Vet Parasitol. 2008 Apr 15;152(3-4):344-8</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">18280661</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>PLoS Negl Trop Dis. 2015 Feb 06;9(2):e0003473</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">25659152</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Med Vet Entomol. 2019 Jun;33(2):185-194</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">30516832</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>J Arthropod Borne Dis. 2013 Apr 10;7(1):83-9</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">23785698</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Parasite. 2011 Aug;18(3):251-60</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">21894267</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Vet Parasitol. 1985 Oct;18(3):281-8</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">4082453</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Malar J. 2016 Feb 13;15:87</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">26872451</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>PLoS Negl Trop Dis. 2016 Jan 15;10(1):e0004351</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">26771833</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>PLoS One. 2012;7(12):e52377</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">23285015</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>PLoS Negl Trop Dis. 2014 Jul 24;8(7):e2984</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">25058611</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>PLoS Negl Trop Dis. 2017 Dec 20;11(12):e0006093</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">29261659</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Vector Borne Zoonotic Dis. 2018 Feb;18(2):114-116</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">29319413</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>Parasitology. 2018 Apr;145(5):665-675</Citation>
<ArticleIdList>
<ArticleId IdType="pubmed">28768559</ArticleId>
</ArticleIdList>
</Reference>
<Reference>
<Citation>PLoS Negl Trop Dis. 2018 Feb 16;12(2):e0006189</Citation>
<ArticleIdList>
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</Reference>
<Reference>
<Citation>Clin Infect Dis. 2009 Aug 15;49(4):543-51</Citation>
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</Reference>
<Reference>
<Citation>Comp Immunol Microbiol Infect Dis. 2014 May;37(3):153-7</Citation>
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</Reference>
<Reference>
<Citation>Parasitology. 2018 Aug;145(9):1170-1182</Citation>
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</Reference>
<Reference>
<Citation>Parasit Vectors. 2014 Jan 14;7:21</Citation>
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